咖啡豆的處理法大致上分成四種，分別是日曬、水洗、蜜處理、厭氧處理，不同處理法會造成之後咖啡豆的風味不同。
日曬法（ｎａｔｕｒａｌ）
將咖啡果實直接攤在陽光下曬乾發酵，曬乾後再將果皮、果肉脫掉。
優點：風味層次豐富，跟水洗法比起來較省水，
缺點：因為在室外曝曬，容易在曝曬過程有沙塵落葉之類雜質混入，另外因為是整顆豆子下去發酵，容易腐壞、發霉或是有蛀蟲
水洗法（ｗａｓｈｅｄ）
將咖啡果實的果皮、果肉去除，保留果膠層放入發酵槽發酵後，用水清洗豆子後烘乾。
優點：酸質明顯，風味乾淨明亮
缺點：用水量大，且過程處理較複雜
蜜處理（ｈｏｎｅｙ）
將咖啡果實的果皮、果肉去除後，咖啡豆裹著果膠層曝曬，方法介於日曬和水洗之間。又分為黃蜜、紅蜜、黑蜜，差別在於裹著的果膠層厚度
優點：風味綜合日曬和水洗的優點
缺點：處理繁瑣耗時
厭氧發酵（ａｎａｅｒｏｂｉｃ ｆｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎ）
將咖啡果實的果皮、果肉去除後，咖啡豆裹著果膠層放入不鏽鋼桶中抽除氧氣發酵。
優點：發酵便因容易控制，咖啡豆風味醇厚度飽滿、有酒香且酸度較低
缺點：細節作法仍在發展階段，作法不定
＊補充：一眼判斷日曬和水洗
日曬豆在烘焙時內銀皮會燒掉而使烘焙完後的咖啡豆中央線沒有白色銀皮殘留；相反，水洗豆的內銀皮會被保留，而使中央線有白色銀皮的存在
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